Les membres de MégaNéo participent à et coordonnent de nombreux projets de recherche :
- PCR Monumentalismes et territoires au Néolithique entre Loire et Charente. Formes et environnements des mégalithes et des enceintes, 2019-2021, responsable Vincent Ard
- ANR MONUMEN, 2018-2022, responsables Vincent Ard et Vivien Mathé
- PCR Structures dolméniques et territoires dans les Pyrénées nord-occidentales, 2017-2019, responsable Pablo Marticorena
- PCR Monumentalismes et territoires au Néolithique entre Loire et Charente. Formes et environnements des mégalithes et des enceintes, 2016-2018, responsable Vincent Ard
- PCR Dynamiques d’occupation et d’exploitation du sel dans les golfes charentais, du Néolithique à l’âge du Fer, 2015-2018, responsables Vincent Ard et Vivien Mathé
- Prospection Thématique Territoires mégalithiques et espaces néolithiques en Ariège, 2017, responsable Sarah Boscus
- Prospection Thématique Les dolmens en Quercy: architectures et implantation territoriales, 2016-2017, responsable Vincent Ard